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Supongo que hablas del programa este para visualizar las imagenes de como quedaria un personaje de anime armable de papel para que te guies en como armarlo ¿cierto?, yo tambien tengo ese programa pero no es necesario combertirlo en pdf, puedes imprimirlo desde el mismo programa y sale bien, solo fijate que cuando bajes el archivo del personaje para ensamblar sea compatible con el pepakura.

Creo que yui te a dado la respuesta mas cercana a tu duda.

Si tienes el office 2007 ,directamente en word le das guardar como: pdf o xps y listo.

No se que programa es se ni para que sirve lo importante es si permite imprimir podrias bajar el pdfcreator ese si hace un pdf de todo programa que imprima solo añadira una impresora en tu computador y mandas a imprimir por ella y creara ese archivo pdf